מעט לאחר השעה 17:30 הגיע מחבל לשער הכותנה בעיר העתיקה בירושלים משטח הר הבית כשהוא חמוש בסכין, שלף אותו והסתער לעבר שני שוטרים של מחוז ירושלים ומג״ב שפעלו במקום.
בתגובה השוטרים השיבו לעברו בירי לעברו והוא נוטרל. כתוצאה מהפיגוע, נפצעו שני שוטרים באורח בינוני ופונו לקבלת טיפול רפואי בבית החולים.
בהמשך נקבע מותו של המחבל, פלסטיני מיו״ש בשנות העשרים לחייו. כוחות משטרה גדולים הוזעקו למקום והחלו באיסוף ממצאים וראיות מזירת הפיגוע.
בשעה האחרונה התקיימה הערכת מצב מיוחדת בראשות מפכ״ל המשטרה רב ניצב יעקב שבתאי, מפקד מחוז ירושלים ניצב דורון תורג׳מן ומפקד משמר הגבול ניצב אמיר כהן בדבר הפיגוע, והמשך ההיערכות והפעילות המבצעית במקום.
בעקבות האירוע, צירי הגישה לזירה נחסמו. שני שוטרים פונו במצב בינוני לשערי צדק, פצוע נוסף פונה במצב קל להדסה הר הצופים.
חובש מד"א ברוך ויסמן סיפר: "כשהגענו לשער הכותנה ראינו את השוטרים מטפלים ב 2 פצועים בשנות ה-20 שסבלו מפצעי דקירה. הוצאנו אותם לרחבת הכותל תוך כדי טיפול רפואי ראשוני שכלל חבישות ועצירת דימומים והעברנו אותם לניידות טיפול נמרץ שפינו אותם לבית החולים כשמצבם יציב."
